Tras las elecciones de 2024, los cinco ayuntamientos de Baja California Sur iniciaron su periodo 2024-2027. La coalición Sigamos Haciendo Historia (MORENA-PT-PVEM) se quedó con cuatro de los cinco municipios —La Paz, Los Cabos, Comondú y Loreto—, mientras que el PAN conservó Mulegé, la única alcaldía de oposición.
En La Paz, Milena Quiroga (MORENA) se convirtió en la primera persona reelecta al frente del municipio. Los Cabos quedó en manos de Christian Agúndez, abanderado del PT dentro de la coalición. Comondú es gobernado por Roberto Pantoja y Loreto por Paz del Alma Ochoa, ambos de MORENA. En Mulegé, Edith Aguilar (PAN) logró la otra reelección histórica del estado.
El rasgo distintivo del nuevo mapa son las primeras reelecciones municipales consecutivas en la historia de BCS, logradas de forma simultánea en La Paz y Mulegé —una por el oficialismo y otra por la oposición—, una señal de continuidad que cruza las líneas partidistas.